Mecklenburg-Vorpommern ist ein gewässerreiches, aber durchaus nicht wasserreiches Land, geprägt durch seine Küstengewässer, seine Flüsse und zahlreichen Seen. Die Gewässer als Bestandteil des Naturhaushaltes und als Lebensgrundlage für Menschen, Tiere und Pflanzen sind zu schützen und zu pflegen, ihre biologische Eigenart und Vielfalt sowie ihre wasserwirtschaftliche Funktionsfähigkeit sind zu erhalten, zu verbessern oder wiederherzustellen.

Schwerpunktaufgaben sind deshalb:

- Erarbeitung von Grundlagen sowie die Koordinierung von Grundlagenarbeiten der Wassermengen- und -gütewirtschaft, des Schutzes, der Sanierung und der Wiederherstellung der ökologischen Funktionsfähigkeit von Gewässern

- Landesweite wasserwirtschaftliche Fachplanungen

- Planung und Koordinierung der Mengen- und Beschaffenheitsüberwachung der Gewässer

- Sonderuntersuchungen zur Beschaffenheit der Gewässer

- Erfassung, Sammlung, Auswertung und Bewertung wasserwirtschaftlicher Daten des Landes

- Veröffentlichung gewässerkundlicher Daten, z.B. im Gewässerkundlichen Jahrbuch, in Gewässergüteberichten

- Aufgaben beim Vollzug des Landeswassergesetzes